蓝藻的体内没有叶绿体，体内含有特殊的色素，一般呈蓝绿色，因而又称作蓝绿藻。因为没有真正的细胞核，因而属于原核生物又被称为“蓝细菌”，在自然界中分布很广，是最原始，最古老的藻类。喜欢生活在有机质丰富、且PH值较高的水体，喜欢高温、强光，多数的蓝藻有固氮作用，能够利用空气中的氮气合成自身需要的氮肥，从而改变水体中的氮磷比。
2、蓝藻产生的原因：
水体的PH值过高，是有利于蓝藻的生长和繁殖；水体中的含氮量过高，因为蓝藻利用其固氮的作用，将水体中多余的氮合成其自身可利用的淡肥从而快速生长；当水温高达25-35℃，光线过强时即达到了蓝藻生长的最佳环境，所以一般在夏季的7、8月份是蓝藻暴发的季节；水体长时间处于氮磷比例失调的状态，由于缺乏有利于有益藻类繁殖生长的磷肥，从而促进了蓝藻的生长；
3、蓝藻的危害：
⑴抑制其他有益藻类的生长。常见的蓝藻主要有微囊藻、螺旋藻、鱼腥藻、颤藻等，其中微囊藻的危害性最大，微囊藻在夏季高温的季节大量繁殖，并在水面形成一层蓝绿色而有腥臭味的浮沫，称为“水华”，大规模的蓝藻爆发，被称为“绿潮”。绿潮引起水质恶化，严重时耗尽水中氧气而造成鱼类的死亡。蓝藻一旦形成优势种群，就会严重破坏水体的生态平衡，其他藻类很少很难繁殖生长，水体很瘦。
⑵蓝藻高峰时能够引起碱中毒。由于光合作用强烈，容易引起水体的PH值急剧升高有时会达到9.5以上，会使水生动物血液的PH值发生变化，从而影响其输氧能力，PH值过高时能直接腐蚀鳃组织，造成呼吸障碍而窒息。并且PH值的升高又进一步促进了蓝藻的繁殖，因而形成蓝藻的恶性循环。
⑶蓝藻的过度繁殖加强氨氮的毒性。蓝藻的恶性繁殖，使水体的PH值升高，如此时遇到水体的氨氮值也偏高，则氨氮的毒性会增强。
⑷蓝藻毒素会引起水生动物中毒。当蓝藻大量死亡后，发出一股难闻的睲臭味，消耗大量的氧气，同时分解产生大量的毒素，主要产毒的蓝藻是鱼腥藻、束丝藻和微囊藻。蓝藻毒素主要有肝毒素、神经毒素、胃肠接触性毒素。会引起水生动物肝脏出血、呼吸衰竭、肠炎等症状。
